A feltelepített és beállított szerverünket üzemeltetni kell, a telepítés ehhez képest alig jelent nehézséget, s az üzemeltetés nehézsége arányosan növekszik a célként kitűzött rendelkezésre állással és a nyújtani kívánt szolgáltatások számával. Az üzemeltetésben sokat segíthetnek olyan programok, amelyek ügyelnek helyettünk a biztonságra (SEC) és a magas rendelkezésreállásra (HA).
Lehetne a telepítés részének is tekinteni a szolgáltatásokat biztosító programok telepítését és konfigurálását, de egy szolgáltatásra akkor is jöhet igény, amikor már hónapok teltek el a telepítés óta.